Viiruse tüüpi gastroenteriit algab iivelduse ja oksendamisega, hiljem esineb kõhulahtisus, temperatuur jõuab 37,5-38 kraadi. Gastroenteriidi inkubatsiooniperiood kestab kaks tundi kuni kaks päeva. Tavaliselt langeb haigus päev või kaks.
Rotaviiruse gastroenteriidi esimene sümptom on tavaliselt oksendamine, enamasti ühekordne oksendamine, mis lõpeb samal päeval. Hiljem algab kõhulahtisus kollase või rohekas väljaheitega, vesine või vahutav, mõnikord limaskestadega. Haiguse lihtsas etapis ilmneb kõhulahtisus 1-2 korda päevas, raskekujulisem - ulatub kakskümmend või enam korda, põhjustades tõsist dehüdratsiooni. Epigastri ümber on tunda kõverat või kramplikut. Inkubatsiooniperiood kestab 15 tundi kuni 5 päeva. Tundub märkimisväärset jõu kaotust. Temperatuur harva ületab 37,5 kraadi ja seda ei juhtu kõigil patsientidel.
Parvoviiruse gastroenteriidi inkubatsiooniperiood on tavaliselt 2-3 päeva. Haigust iseloomustab nõrkus, soolte turse, iiveldus ja oksendamine, võib sellega kaasneda pearinglus ja lihasvalu. Kõhulahtisus on haruldane, valu on nõrk või üldse mitte.
Bakteritüübiga temperatuur võib ulatuda 39 kraadini. Tool ei ole külluses, mõnikord valuliselt tungivalt, sisaldab see sisaldust lima ja verd, mis näitab jämesoole kahjustust. Oksendamine juhtub üsna harva, kõhupiirkonnas on valude võitlused. Bakteriaalse gastroenteriidi inkubatsiooniperiood kestab kaks päeva nädalas.
Salmonella poolt põhjustatud kahjustuste korral püsib gastroenteriidi inkubatsiooniperiood 12 tundi kuni 24 tundi pärast saastunud toodete kasutamist. Haigus ilmneb terava hinnatõusu, peavalude tõttu. Hiljem on iiveldus, epigasmistuv valu ja oksendamine, mille sisust on leitud sapi segunemine. Siis algab kõhulahtisus ja kõht on rumal. Haigus põhjustab sageli rasket dehüdratsiooni.
Staphylococcal gastroenteriit erineb epigastiri kärpides ja sagedastes oksendamisraskustes. Kõhulahtisus juhtub harva. Haigus võib kesta 1-3 päeva. Esimese päeva lõpuks patsient tunneb ennast paremini.
Kui haigus on kerge, valulikud manifestatsioonid kestavad 1-3 päeva, raskemad - tundub nädala jooksul. Kõige sagedamini haigus kestab lühikest aega ja lõpeb kiire taastumisega.