Nastajanje zaštitnih reakcija tijela, tj. Imunitet, nemoguće je bez aktivnog sudjelovanja u ovom procesu normalne crijevne mikroflore. Kod dysbakterijusa u mikroflori crijeva postoji pomak kvantitativnog pariteta mikroorganizama u korist patogena kod kojih se normalni rad tog organa sloma, pa prema tome dolazi do slabljenja imuniteta. S druge strane, njegovo slabljenje dovodi do povećanja broja patogenih mikroorganizama u crijevnoj mikroflori, što je karakteristično za disbiozu. Ispada da imunitet i disbakterija su neraskidivo povezani jedni s drugima.
Shema međusobnog utjecaja imuniteta i biološke ravnoteže u crijevu najlakše je vidjeti na primjeru djeteta. U vrijeme rođenja, bebina mikroflora je apsolutno čista i imunitet se tek počinje stvarati uz pomoć takozvanih specijalnih sredstava imunološkog sustava. Dysbacteriosis narušava funkcioniranje limfoidnih stanica, koje sintetiziraju imunoglobuline i lizozime, koji štite tijelo od infekcija. U ovom slučaju, razni alergeni, otrovne supstancije koje su prethodno blokirane crijevnom mikroflora, kada su povrijeđene, ulaze u krvotok i inficiraju tijelo.
Otoci limfnog tkiva koji obavljaju zaštitnu funkciju prvenstveno su osjetljivi na destruktivne promjene disbioze. Kršenje probavnih i apsorpcijskih procesa dovodi do ograničavanja asimilacije hranjivih tvari, vitamina, mikroelemenata i konačno do imunodeficijencije ljudskog tijela. Određeni začarani krug nastaje kada imunodeficijent čini crijevnu mikrofloru dostupnu za prodiranje patogenih bakterija i toksina. Stoga je liječenje disbakterijusa bez utjecaja na imunitet vrlo teško, gotovo nemoguće, posebno u djetinjstvu.
Stvaranje crijevne mikroflore prolazi kroz sljedeće faze:
- Mikroorganizmi koji ulaze u crijeva iz majčinog tijela.
- Mlijeko majke množe korisne lakto- i bifidobakterije.
- Oblikovanje dobrog imuniteta.
U budućem procesu međudjelovanja crijevnih mikroba s zaštitnim silama djeteta, mikroorganizmi koji žive u mikroflori omogućuju zadržavanje vrlo starosti dobrom imunitetu ljudskog tijela. Korisna uloga mikroba također leži u činjenici da oni koji jedu tvari napuštaju patogenim mikroorganizmima prehrambenih navika.